Debido a las demandas de los visitantes y habitantes de cada aldea, se realizan misiones ya sean de protección, de mantenimiento de la aldea, para capturar a otros ninjas o de otros tipos. También sirven para ascender de rango. Para que un ninja vaya consiguiendo el rango de Chuunin, Jounin, o Kage deberá de superar exámenes y realizar misiones. Según que rango tenga el ninja - Gennin, Chuunin, Jounin o Kage -, este hará una misiones de un rango u otro
MISIONES DE RANGO S:
Actualmente sabemos poco de las misiones de rango S, pero si sabemos que las desarrollan los mejores Jounins o el propio Kage.
MISIONES DE RANGO A:
Las misiones del rango A suelen ser llevadas por los mejores Jounin. Si la misión fuera demasiado peligrosa la haría el Kage de la aldea. Suele ser del tipo matar/capturar a un ninja del rango S, sellar algún demonio, etc.
MISIONES DE RANGO B:
Las misiones de rango B suelen ser bastante difíciles. Suelen ser desarrolladas por Chuunins con experiencia y también puede que por Jounins. Tratan sobre escoltar a alguna persona, recuperar unos documentos importantes y en ocasiones hasta asesinar.
MISIONES DE RANGO C:
Las misiones de rango C suelen ser encargadas a ninjas de rango Chuunin o a un grupo de ninjas Genin acompañados de un ninja Jounin. Suelen ser: transportar documentos no muy importantes o escoltar a alguien
MISIONES DE RANGO D:
Los las misiones que se otorgan a los ninjas de rango inferior, los Gennins. Suelen ser misiones muy aburridas sobre tareas rutinarias como puede ser de mantenimiento de la aldea o cuidar bebés.